1941. október 21-én született Budapesten. Apja Jankovics Marcell (1906-1970), banktisztviselő, nagyapja id. Jankovics Marcell (1874–1949), író, politikus, ügyvéd volt. Apját 1950-ben koholt vádak alapján letartóztatták, és életfogytiglani kényszermunkára ítélték. '56-ban kiszabadították; a forradalom leverése után felügyelettel szabadlábon maradhatott. Közben családját 1951-ben kitelepítették, ahonnan csak 1953-ban térhettek vissza. A gyermek Marcell 1955-től a Pannonhalmi Bencés Gimnáziumba járt, itt is érettségizett. Így emlékezik itteni éveire: "Mit adott a pannonhalmi gimnázium? Például csodálatos természeti környezetet, páratlan napfelkeltéket. Az iskola, a kollégium miliője pedig a középkor iránti vonzódásom miatt is meghatározó volt. Továbbá a bencés gimnázium adott nekem a maga szigorával egy mintaszerű munkakultúrát. Az ott megszerzett érettségi mögött olyan tudásnak kell lennie, ami sok esetben meghaladja azt, amit egy mai diplomához feltételül szabnak."
1959-1960-ban segédmunkásként dolgozott, majd 1960-tól a Pannónia Filmvállalathoz (ma Pannóniafilm kft) került, ahol fázisrajzolóként kezdett dolgozni. 1965-ben rendezőnek nevezték ki. 1965-től 1968-ig Dargay Attilával és Nepp Józseffel közösen készítették a nagy sikerű Gusztáv című rajzfilmsorozatot. 1971-72-ben a Képző- és Iparművészeti Gimnáziumban tanított animációt. 1973-ban a Hanna-Barbera megvette a János vitéz forgalmazási jogát angol nyelvterületre, örök időkre. Soha nem vetítették. 1974-ben Sisyphus c. munkáját Oscar-díjra jelölték. 1977-ben elnyerte a Cannes-i Filmfesztivál Arany Pálma-díját a rövidfilmek kategóriájában, Kűzdők c. filmjével, de az akkori kultúrpolitika jellemző epizódjaként Jankovics helyett mást küldtek ki a díj átvételére. 1981-től pedig az Iparművészeti Főiskolán tanít szintén animációt.
1983-ban elkészült Az ember tragédiájának animációs film forgatókönyve. 1994-től a Magyar Művészeti Akadémia tagja lett.
1996-tól kinevezték a Pannóniafilm Kft ügyvezető igazgatójává. Még ugyanebben az évben megpályázta a Duna Televízió elnöki posztját, sikertelenül. 1997-től a Magyar Iparművészeti Egyetem DLA minősítésű egyetemi magántanára lett. 1998-2002 a Nemzeti Kulturális Alap elnöke. 1998-tól Magyar Művelődési Társaság elnöke. 2003-tól a Fidesz Kulturális Tagozatának elnökségi tagja.
Főbb díjai: Balázs Béla-díj (1974), Arany Pálma-díj (1977), Kossuth-díj (1978), érdemes művész (1984), Minden idők legjobb rajzfilmje-díj a Fehérlófia c. rajzfilmjéért (Los Angeles, 1984), Életfa-díj (1988), a Magyar Köztársasági Érdemrend középkeresztje (1998)
Filmjei:
Rendezőként
- Ének a csodaszarvasról (2002)
- Mondák a magyar történelemből (1986)
- Fehérlófia (1982)
- Kacor király (1978)
- Magyar népmesék (sorozat) (1977)
- Küzdők (1977)
- Sisyphus (1975)
- János vitéz (1973)
- Hídavatás (1969)
- Tendenciar (1967)
- Gusztáv, a társas lény (1965)
- Jónás és a cet (1963)
Forgatókönyvíróként
- Ének a csodaszarvasról (2002)Küzdők (1977)
- János vitéz (1973)
- Tendenciar (1967)
Könyvei
- Kiadás éve Kiadó Cím Téma
- 1991 Csokonai A fa mitológiája Mitológia
- 1996 Csokonai A nap könyve Mitológia, jelkép, kultúrtörénet
- 1996 Pontifex Ahol a madár se jár Mitológia, jelkép, kultúrtörénet
- 1997 Csokonai Jelkép-kalendárium A naptár és az égi mozgások összefüggése
- 1998 Csokonai Mély a múltnak kútja Karácsony, történelem, csillagos ég
- 2004 Csokonai A szarvas könyve A csodaszarvas szimboluma
- 2006 Mery RATIO Csillagok közt fényességes csillag A Szent László legenda és a csillagos ég
- 2007 Helikon Lékiratok I.-II. Családi emlékek 1960-ig
- 2008 Csokonai 3+1 A négy évszak szimbolikája A négyes szám szimbolikája
- 2013 Csokonai Mese, film és álom I-II. A mese, a film és az álom kapcsolata
- 2015 Akadémiai Képes Bibliai történetek A tervezett biblia film irodalmi és képi anyaga
- 2015 Akadémiai A vizuális nevelésről Tanulmány a vizualitásról és a nemzeti alaptantervről (NAT)
- 2019 Mery RATIO Trianon Trianon előzményei és következményei gúnyrajzokon
Könyvei társszerzőkkel
- Kiadás éve Kiadó Cím Téma Társszerzők
- 2010 Helikon Jelképtár (7. kiadás) Jelképek lexikona, közel 500 szócikk Hoppál Mihály, Nagy András, Szemadán Györ
- 2007 Méry RATIO A lőcsei Szent Jakab templom szárnyasoltárai A templom művészettörténeti leírása és fotói Méry Gábor fotók
- 2007 Méry RATIO A kassai Szent Erzsébet dóm A templom művészettörténeti leírása és fotói Méry Gábor fotók
- 2009 Méry RATIO A bártfai Szent Egyed bazilika A templom művészettörténeti leírása és fotói Méry Gábor fotók
- 2010 Méry RATIO A szepeshelyi Szent Márton székesegyház A templom művészettörténeti leírása és fotói Méry Gábor fotók
- 2011 Méry RATIO A szepesszomati Szent György templom A templom művészettörténeti leírása és fotói Méry Gábor fotók
- 2012 Méry RATIO A bakabányai Szent Miklós templom A templom művészettörténeti leírása és fotói Méry Gábor fotók
- 2013 Méry RATIO A késmárki Szent Kereszt bazilika A templom művészettörténeti leírása és fotói Méry Gábor fotók
- 2014 Méry RATIO Szmrecsány Szűz Mária temploma A templom művészettörténeti leírása és fotói Méry Gábor fotók
- 2017 Méry RATIO Héthárs Szent Márton temploma A templom művészettörténeti leírása és fotói Méry Gábor fotók
- 2018 Méry RATIO Kakaslomnic Szent Katalin temploma A templom művészettörténeti leírása és fotói Méry Gábor fotók